Occurrence

UNESCO eDNA expedition in Archipiélago de Revillagigedo (Mexico): April 2023

Последняя версия опубликована OBIS Secretariat 8 декабря 2024 г. OBIS Secretariat
Дата публикации:
8 декабря 2024 г.
Published by:
OBIS Secretariat
Лицензия:
CC0 1.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 178 507 Записи в English (19 MB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (12 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Описание

This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 178 507 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
178507
dnaDerivedData 
178507

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Melesio Tiscareño Villorin J, Erendida Frías Hernández L, Hernández González O, Rivera Reyes N, Berumen Solórzano P, Vargas Cossio P, Ávila García B, Guadalupe Villavicencio Rousseau G, López Payán F, Munguia Vega A, Manuel Duarte Ramos F, Carlos Fernando San Esteban Belmar J, Suominen S, Provoost P, Gillard E, Douvere F, Appeltans W (2024). UNESCO eDNA expedition in Archipiélago de Revillagigedo (Mexico): April 2023. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/mp4qin

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является OBIS Secretariat. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс не был зарегистрирован в GBIF

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Josué Melesio Tiscareño Villorin
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Luz Erendida Frías Hernández
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Osvaldo Hernández González
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Nathaniel Rivera Reyes
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Penélope Berumen Solórzano
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Paul Vargas Cossio
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Blas Ávila García
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Georgina Guadalupe Villavicencio Rousseau
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Fátima López Payán
  • Originator
Revillagigedo National Park, National Commission of Protected Natural Areas - CONANP, Mexico
Adrián Munguia Vega
  • Originator
Conservation Genetics Lab, University of Arizona, United States of America
Fernando Manuel Duarte Ramos
  • Originator
Autonomus University of Baja California Sur, Mexico
José Carlos Fernando San Esteban Belmar
  • Originator
Autonomus University of Baja California Sur, Mexico
Saara Suominen
  • Originator
UNESCO-IOC
Pieter Provoost
  • Metadata Provider
  • Originator
  • User
  • Point Of Contact
UNESCO-IOC
Elle Gillard
  • Originator
UNESCO-WHC
Fanny Douvere
  • Originator
UNESCO-WHC
Ward Appeltans
  • Originator
UNESCO-IOC

Географический охват

global

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 10.25607/mp4qin
https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=edna-archipielago-de-revillagigedo