オカレンス（観察データと標本)

UNESCO eDNA expedition in Everglades National Park (United States): April 2023

最新バージョン OBIS Secretariat によって公開 2024/12/08 OBIS Secretariat
公開日:
2024/12/08
Published by:
OBIS Secretariat
ライセンス:
CC0 1.0

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DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 77,932 レコード English で (8 MB) - 更新頻度: unknown
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RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (7 KB)

説明

This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、77,932 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
77932
dnaDerivedData 
77932

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Ramos P, Melodie Naja G, Gantt A, Suominen S, Provoost P, Gillard E, Douvere F, Appeltans W (2024). UNESCO eDNA expedition in Everglades National Park (United States): April 2023. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/bjffju

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は OBIS Secretariat。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF登録

このリソースは GBIF に登録されていません。

キーワード

Occurrence

連絡先

Pedro Ramos
  • 最初のデータ採集者
National Park Service, United States of America
Ghinwa Melodie Naja
  • 最初のデータ採集者
National Park Service, United States of America
Allyson Gantt
  • 最初のデータ採集者
National Park Service, United States of America
Saara Suominen
  • 最初のデータ採集者
UNESCO-IOC
Pieter Provoost
  • メタデータ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者 ●
  • データ利用者 ●
  • 連絡先
UNESCO-IOC
Elle Gillard
  • 最初のデータ採集者
UNESCO-WHC
Fanny Douvere
  • 最初のデータ採集者
UNESCO-WHC
Ward Appeltans
  • 最初のデータ採集者
UNESCO-IOC

地理的範囲

global

座標（緯度経度） 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180]

追加のメタデータ