Occurrence

UNESCO eDNA expedition in French Austral Lands and Seas (France): December 2022 and April 2023

Последняя версия опубликована OBIS Secretariat 8 декабря 2024 г. OBIS Secretariat
Дата публикации:
8 декабря 2024 г.
Published by:
OBIS Secretariat
Лицензия:
CC0 1.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 51 296 Записи в English (5 MB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (10 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (8 KB)

Описание

This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 51 296 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
51296
dnaDerivedData 
51296

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Saucède T, Motreuil S, Marschal C, Mignucci A, Marinesque S, Salvatico P, Guéné M, Suominen S, Provoost P, Gillard E, Douvere F, Appeltans W (2024). UNESCO eDNA expedition in French Austral Lands and Seas (France): December 2022 and April 2023. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/qoxzeg

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является OBIS Secretariat. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс не был зарегистрирован в GBIF

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Thomas Saucède
  • Originator
Université de Bourgogne, France
Sébastien Motreuil
  • Originator
Centre national de la recherche scientifique - CNRS, France
Christian Marschal
  • Originator
Centre national de la recherche scientifique - CNRS, France
Alexandre Mignucci
  • Originator
Les Terres australes et antarctiques françaises - TAAF, France
Sophie Marinesque
  • Originator
Les Terres australes et antarctiques françaises - TAAF, France
Pauline Salvatico
  • Originator
Les Terres australes et antarctiques françaises - TAAF, France
Mathilde Guéné
  • Originator
Les Terres australes et antarctiques françaises - TAAF, France
Saara Suominen
  • Originator
UNESCO-IOC
Pieter Provoost
  • Metadata Provider ●
  • Originator ●
  • User ●
  • Point Of Contact
UNESCO-IOC
Elle Gillard
  • Originator
UNESCO-WHC
Fanny Douvere
  • Originator
UNESCO-WHC
Ward Appeltans
  • Originator
UNESCO-IOC

Географический охват

global

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 10.25607/qoxzeg
https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=edna-french-austral-lands-and-seas