UNESCO eDNA expedition in Gulf of Porto: Calanche of Piana, Gulf of Girolata, Scandola Reserve (France): March 2023

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Descrição

This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 97.199 registros.

Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

97199

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Faggio G, Olmeta M, Matoux-Dragacci Q, Mary J, Lenormand V, Pompei M, Astruc J, Achilli J, Dominic J, Paolini F, Marcelli V, Angelini C, Pagnini A, Suominen S, Provoost P, Gillard E, Douvere F, Appeltans W (2024). UNESCO eDNA expedition in Gulf of Porto: Calanche of Piana, Gulf of Girolata, Scandola Reserve (France): March 2023. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/ydmsdm

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é OBIS Secretariat. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF Registration

Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Palavras-chave

Occurrence

Contatos

Gilles Faggio

Originador

Office de l’Environnement de la Corse

Margaux Olmeta

Originador

Office de l’Environnement de la Corse

Quentin Matoux-Dragacci

Originador

Office de l’Environnement de la Corse

Jean-Baptiste Mary

Originador

Office de l’Environnement de la Corse

Virgil Lenormand

Originador