UNESCO eDNA expedition in Lagoons of New Caledonia: Reef Diversity and Associated Ecosystems (France): March 2023

Событие
Последняя версия опубликовано OBIS Secretariat дек. 8, 2024 OBIS Secretariat
Дата публикации:
8 декабря 2024 г.
Опубликовано:
OBIS Secretariat
Лицензия:
CC0 1.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 178 367 Записи в English (20 MB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (8 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (8 KB)

Описание

This dataset contains the eDNA data collected as a part of the UNESCO eDNA expeditions in Marine World Heritage Sites project in 2022-2024. The project was coordinated in collaboration with the Ocean Biodiversity Information System (OBIS) of IOC-UNESCO and the marine programme of the UNESCO World Heritage Center, and funded by the government of Flanders (Kingdom of Belgium). The samples were collected with citizen science eDNA sampling kits, containing a syringe and a filter, and preserved with Longmire's buffer, before sequencing at a central laboratory. Five different biomarkers were analysed, including 12SMifish, Mimammal, Teleo, 16S-Vert and COI markers. The sequences were analysed with the PacMAN pipeline and quality controlled including a validation check by local scientists and site managers as well as compared to existing knowledge on species distributions in OBIS and GBIF. The full sampling protocols and materials are available on the project website (https://www.unesco.org/en/edna-training-materials?hub=66910), and the bioinformatics pipeline is on github (https://github.com/iobis/PacMAN-pipeline). The data can also be explored on the eDNA expeditions dashboard (https://dashboard.ednaexpeditions.org/).

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 178 367 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
178367
dnaDerivedData 
178367

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Vigliola L, Morlon A, Suominen S, Provoost P, Gillard E, Douvere F, Appeltans W (2024). UNESCO eDNA expedition in Lagoons of New Caledonia: Reef Diversity and Associated Ecosystems (France): March 2023. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/0mph4t

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является OBIS Secretariat. Насколько это возможно по закону, издатель отказался от всех прав на эти данные и посвятил их Public Domain (CC0 1.0). Пользователи могут без ограничений копировать, изменять, распространять и использовать работу, в том числе в коммерческих целях.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: b2f19afe-52d7-4d10-80fe-861e7ec76804.  OBIS Secretariat отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Ocean Biodiversity Information System.

Ключевые слова

Occurrence

Контакты

Laurent Vigliola
  • Originator
ENTROPIE, IRD-UR-UNC-IFREMER-CNRS
Anaïs Morlon
  • Originator
New Caledonian Biodiversity Agency (ANCB)
Saara Suominen
  • Originator
UNESCO-IOC
Pieter Provoost
  • User
UNESCO-IOC
Elle Gillard
  • Originator
UNESCO-WHC
Fanny Douvere
  • Originator
UNESCO-WHC
Ward Appeltans
  • Originator
UNESCO-IOC
Pieter Provoost
  • User
  • data manager
UNESCO
Pieter Provoost
  • User

Географический охват

global

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 10.25607/0mph4t
https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=edna-lagoons-of-new-caledonia