Descripción
Here we pilot a novel, rapid and non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach specifically targeted to infer shark presence, diversity and eDNA read abundance in tropical habitats. We identified at least 21 shark species, from both Caribbean and Pacific Coral Sea water samples, whose geographical patterns of diversity and read abundance coincide with geographical differences in levels of anthropogenic pressure and conservation effort. We demonstrate that eDNA metabarcoding can be effectively employed to study shark diversity.
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 509 registros.
también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Bakker J, Wangensteen O S, Chapman D D, Boussarie G, Buddo D, Guttridge T L, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S, Earl C (2023). Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/tciqld
Derechos
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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es OBIS Secretariat. En la medida de lo posible según la ley, el publicador ha renunciado a todos los derechos sobre estos datos y los ha dedicado al Dominio público (CC0 1.0). Los usuarios pueden copiar, modificar, distribuir y utilizar la obra, incluso con fines comerciales, sin restricciones.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977. OBIS Secretariat publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Ocean Biodiversity Information System.
Palabras clave
Occurrence
Contactos
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Cobertura geográfica
Lagoons of New Caledonia
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [-23,127, 162,726], Latitud Máxima Longitud Máxima [-17,899, 167,747] |
|---|
Cobertura taxonómica
Fishes
| Superclase | Agnatha |
|---|---|
| Unranked | Chondrichthyes, Osteichthyes |
Métodos de muestreo
No hay descripción disponible
Descripción de la metodología paso a paso:
- See Github Project and R Notebook for dataset construction methods
Referencias bibliográficas
- Bakker, J., Wangensteen, O.S., Chapman, D.D. et al. Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Sci Rep 7, 16886 (2017). https://doi.org/10.1038/s41598-017-17150-2
Metadatos adicionales
marine, harvested by iOBIS
| Propósito | These data were made accessible through UNESCO's eDNA Expeditions project to mobilize available marine species and occurrence datasets from World Heritage Sites. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | 10.25607/tciqld |
| af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977 | |
| https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=new-caledonia-bakker-2017 |