オカレンス（観察データと標本)

Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact

最新バージョン OBIS Secretariat によって公開 2023/10/25 OBIS Secretariat
公開日:
2023/10/25
Published by:
OBIS Secretariat
ライセンス:
CC0 1.0

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DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 509 レコード English で (40 KB) - 更新頻度: not planned
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説明

Here we pilot a novel, rapid and non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach specifically targeted to infer shark presence, diversity and eDNA read abundance in tropical habitats. We identified at least 21 shark species, from both Caribbean and Pacific Coral Sea water samples, whose geographical patterns of diversity and read abundance coincide with geographical differences in levels of anthropogenic pressure and conservation effort. We demonstrate that eDNA metabarcoding can be effectively employed to study shark diversity.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、509 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
509
dnaDerivedData 
509

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Bakker J, Wangensteen O S, Chapman D D, Boussarie G, Buddo D, Guttridge T L, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S, Earl C (2023). Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/tciqld

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は OBIS Secretariat。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977が割り当てられています。   Ocean Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているOBIS Secretariat が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence

連絡先

Judith Bakker
  • 最初のデータ採集者
University of Salford
Owen S. Wangensteen
  • 最初のデータ採集者
University of Salford
Demian D. Chapman
  • 最初のデータ採集者
Florida International University
Germain Boussarie
  • 最初のデータ採集者
Université Montpellier
Dayne Buddo
  • 最初のデータ採集者
University of the West Indies
Tristan L. Guttridge
  • 最初のデータ採集者
Bimini Biological Field Station Foundation
Heidi Hertler
  • 最初のデータ採集者
The SFS Centre for Marine Resource Studies
David Mouillot
  • 最初のデータ採集者
Université Montpellier
Laurent Vigliola
  • 最初のデータ採集者
Laboratoire d’Excellence Labex Corail
Stefano Mariani
  • 最初のデータ採集者
University of Salford
Chandra Earl
  • メタデータ提供者 ●
  • データ処理者
eDNA Scientific Officer
UNESCO
OBIS Secretariat
  • 連絡先
Secretariat
OBIS

地理的範囲

Lagoons of New Caledonia

座標（緯度経度） 南 西 [-23.127, 162.726], 北 東 [-17.899, 167.747]

生物分類学的範囲

Fishes

Superclass Agnatha
Unranked Chondrichthyes, Osteichthyes

収集方法

説明がありません

Method step description:

  1. See Github Project and R Notebook for dataset construction methods

書誌情報の引用

  1. Bakker, J., Wangensteen, O.S., Chapman, D.D. et al. Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Sci Rep 7, 16886 (2017). https://doi.org/10.1038/s41598-017-17150-2

追加のメタデータ

marine, harvested by iOBIS

目的 These data were made accessible through UNESCO's eDNA Expeditions project to mobilize available marine species and occurrence datasets from World Heritage Sites.
代替識別子 10.25607/tciqld
af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977
https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=new-caledonia-bakker-2017