Описание
Here we pilot a novel, rapid and non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach specifically targeted to infer shark presence, diversity and eDNA read abundance in tropical habitats. We identified at least 21 shark species, from both Caribbean and Pacific Coral Sea water samples, whose geographical patterns of diversity and read abundance coincide with geographical differences in levels of anthropogenic pressure and conservation effort. We demonstrate that eDNA metabarcoding can be effectively employed to study shark diversity.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 509 записей.
Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Bakker J, Wangensteen O S, Chapman D D, Boussarie G, Buddo D, Guttridge T L, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S, Earl C (2023). Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/tciqld
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является OBIS Secretariat. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977. OBIS Secretariat отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Ocean Biodiversity Information System.
Ключевые слова
Occurrence
Контакты
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
- Originator
Географический охват
Lagoons of New Caledonia
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [-23,127, 162,726], Север Восток [-17,899, 167,747] |
|---|
Таксономический охват
Fishes
| Superclass | Agnatha |
|---|---|
| Unranked | Chondrichthyes, Osteichthyes |
Методы сбора
Описание отсутсвует
Описание этапа методики:
- See Github Project and R Notebook for dataset construction methods
Библиографические ссылки
- Bakker, J., Wangensteen, O.S., Chapman, D.D. et al. Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Sci Rep 7, 16886 (2017). https://doi.org/10.1038/s41598-017-17150-2
Дополнительные метаданные
marine, harvested by iOBIS
| Цель | These data were made accessible through UNESCO's eDNA Expeditions project to mobilize available marine species and occurrence datasets from World Heritage Sites. |
|---|---|
| Альтернативные идентификаторы | 10.25607/tciqld |
| af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977 | |
| https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=new-caledonia-bakker-2017 |