出現紀錄

Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact

最新版本 由 OBIS Secretariat 發佈於 2023年10月25日 OBIS Secretariat
發布日期:
2023年10月25日
Published by:
OBIS Secretariat
授權條款:
CC0 1.0

下載最新版本的 Darwin Core Archive (DwC-A) 資源,或資源詮釋資料的 EML 或 RTF 文字檔。

DwC-A資料集 下載 509 紀錄 在 English 中 (40 KB) - 更新頻率: 無計畫更新
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元數據RTF文字檔 下載 在 English 中 (9 KB)

說明

Here we pilot a novel, rapid and non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach specifically targeted to infer shark presence, diversity and eDNA read abundance in tropical habitats. We identified at least 21 shark species, from both Caribbean and Pacific Coral Sea water samples, whose geographical patterns of diversity and read abundance coincide with geographical differences in levels of anthropogenic pressure and conservation effort. We demonstrate that eDNA metabarcoding can be effectively employed to study shark diversity.

資料紀錄

此資源出現紀錄的資料已發佈為達爾文核心集檔案(DwC-A),其以一或多組資料表構成分享生物多樣性資料的標準格式。 核心資料表包含 509 筆紀錄。

亦存在 1 筆延伸集的資料表。延伸集中的紀錄補充核心集中紀錄的額外資訊。 每個延伸集資料表中資料筆數顯示如下。

Occurrence (核心)
509
dnaDerivedData 
509

此 IPT 存放資料以提供資料儲存庫服務。資料與資源的詮釋資料可由「下載」單元下載。「版本」表格列出此資源的其它公開版本,以便利追蹤其隨時間的變更。

版本

以下的表格只顯示可公開存取資源的已發布版本。

如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Bakker J, Wangensteen O S, Chapman D D, Boussarie G, Buddo D, Guttridge T L, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S, Earl C (2023). Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/tciqld

權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 OBIS Secretariat。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊,並指定以下之GBIF UUID: af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977。  OBIS Secretariat 發佈此資源,並經由Ocean Biodiversity Information System同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Occurrence

聯絡資訊

Judith Bakker
  • 出處
University of Salford
Owen S. Wangensteen
  • 出處
University of Salford
Demian D. Chapman
  • 出處
Florida International University
Germain Boussarie
  • 出處
Université Montpellier
Dayne Buddo
  • 出處
University of the West Indies
Tristan L. Guttridge
  • 出處
Bimini Biological Field Station Foundation
Heidi Hertler
  • 出處
The SFS Centre for Marine Resource Studies
David Mouillot
  • 出處
Université Montpellier
Laurent Vigliola
  • 出處
Laboratoire d’Excellence Labex Corail
Stefano Mariani
  • 出處
University of Salford
Chandra Earl
  • 元數據提供者
  • 處理者
eDNA Scientific Officer
OBIS Secretariat
  • 連絡人
Secretariat

地理涵蓋範圍

Lagoons of New Caledonia

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [-23.127, 162.726], 緯度北界 經度東界 [-17.899, 167.747]

分類群涵蓋範圍

Fishes

Superclass Agnatha
Unranked Chondrichthyes, Osteichthyes

取樣方法

無相關描述

方法步驟描述:

  1. See Github Project and R Notebook for dataset construction methods

引用文獻

  1. Bakker, J., Wangensteen, O.S., Chapman, D.D. et al. Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Sci Rep 7, 16886 (2017). https://doi.org/10.1038/s41598-017-17150-2

額外的詮釋資料

marine, harvested by iOBIS

目的 These data were made accessible through UNESCO's eDNA Expeditions project to mobilize available marine species and occurrence datasets from World Heritage Sites.
替代的識別碼 10.25607/tciqld
af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977
https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=new-caledonia-bakker-2017