Descrição
Here we pilot a novel, rapid and non-invasive environmental DNA (eDNA) metabarcoding approach specifically targeted to infer shark presence, diversity and eDNA read abundance in tropical habitats. We identified at least 21 shark species, from both Caribbean and Pacific Coral Sea water samples, whose geographical patterns of diversity and read abundance coincide with geographical differences in levels of anthropogenic pressure and conservation effort. We demonstrate that eDNA metabarcoding can be effectively employed to study shark diversity.
Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 509 registros.
Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versões
A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.
Como citar
Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:
Bakker J, Wangensteen O S, Chapman D D, Boussarie G, Buddo D, Guttridge T L, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S, Earl C (2023). Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Version 2.0. OBIS Secretariat. Occurrence dataset. https://doi.org/10.25607/tciqld
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é OBIS Secretariat. To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977. OBIS Secretariat publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Ocean Biodiversity Information System.
Palavras-chave
Occurrence
Contatos
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Cobertura Geográfica
Lagoons of New Caledonia
| Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [-23,127, 162,726], Norte Leste [-17,899, 167,747] |
|---|
Cobertura Taxonômica
Fishes
| Superclasse | Agnatha |
|---|---|
| Unranked | Chondrichthyes, Osteichthyes |
Métodos de Amostragem
Nenhuma descrição disponível
Descrição dos passos do método:
- See Github Project and R Notebook for dataset construction methods
Citações bibliográficas
- Bakker, J., Wangensteen, O.S., Chapman, D.D. et al. Environmental DNA reveals tropical shark diversity in contrasting levels of anthropogenic impact. Sci Rep 7, 16886 (2017). https://doi.org/10.1038/s41598-017-17150-2
Metadados Adicionais
marine, harvested by iOBIS
| Propósito | These data were made accessible through UNESCO's eDNA Expeditions project to mobilize available marine species and occurrence datasets from World Heritage Sites. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | 10.25607/tciqld |
| af6f962a-3dad-43df-a9e3-36ad528a4977 | |
| https://ipt.obis.org/secretariat/resource?r=new-caledonia-bakker-2017 |